수출진흥사업단은 ▲보건산업 수출진흥 사업기획 및 전략개발 ▲해외시장 정보 등 수출·입 자료 조사분석 및 정보제공 ▲보건산업체의 해외진출 및 마케팅 지원 ▲수출전략품목 및 유망산업체 선정 지원 ▲보건산업체 해외바이어 확보 및 서비스 제공 등의 업무를 수행한다.
그리고 국제통상 및 국제협력, 국내·외 박람회 지원, 해외지소 설치·운영 등도 주관하게 된다. 아울러 진흥원은 기존의 정책전략기획단을 산업기반진흥사업단으로 변경하고, 기존 업무를 포함해 보건산업제품의 표준화 및 보건산업분야별 산업체 육성·지원 업무를 맡도록 했다.
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